turkmath.org

Türkiye'deki Matematiksel Etkinlikler


08 Kasım 2023, 15:00


Galatasaray Üniversitesi Matematik Bölümü Seminerleri

A theoretical and computational framework for upscaling epithelial subcellular dynamics to tissue mechanics

Adam Ouzeri
Galatasaray University, Türkiye

 Recent observations across various species have revealed a rich phenomenology of epithelial mechanics arising from the active-viscoelasticity and turnover of the actomyosin cortex. However, a link between the subcellular cortical dynamics and the tissue scale response has been lacking in theoretical models of epithelia. For instance, in classical vertex models, a phenomenologically motivated work function governing the vertex dynamics (Alt et al, Philos. Trans. R. Soc. Lond., B, Biol. Sci., 2017) often lacks a direct connection to the microscopic subcellular physics. In this talk, I will present a new formalism, coined active-gel tissue model (AGTM), which bridges the active-gel models of the actomyosin cortex taking into account the active contractility of the cortex, the viscoelastic relaxation due network remodelling and the turnover of its constituents, with vertex-like models at a tissue scale. By solving the active gel on each of the curved faces of a 3D tissue, we show that this unified framework systematically links subcellular cortical dynamics with tissue mechanics, and ties to a common subcellular origin a number of seemingly disconnected dynamical tissue behaviours such as stress relaxation following step-strain manoeuvres (Casares et al., Nat. Mat. 2015, Khalilgharibi et al, Nat. Phys., 2019), buckling and transient buckling upon compression (Wyatt et al, Nat. Mat., 2020), pulsatile contractions during Drosophila dorsal closure (Solon et al, Cell, 2009), spontaneous curling (Fouchard et al, PNAS, 2020) and active superelasticity (Latorre et al, Nature, 2018). This framework is compatible with more elaborate dynamical models of the cytoskeleton, of adhesion complexes and their interaction, and thus serves as a general background for combining more complex multi-species models accounting for regulatory networks and junctional rearrangements, potentially providing a mechanistic understanding of active non-linear response of tissues with cell level resolution.

Uygulamalı Matematik İngilizce
Galatasaray Universitesi H304

gsu3 06.11.2023

Yaklaşan Seminerler Seminer Arşivi
 

İLETİŞİM

Akademik biriminizin ya da çalışma grubunuzun ülkemizde gerçekleşen etkinliklerini, ilan etmek istediğiniz burs, ödül, akademik iş imkanlarını veya konuk ettiğiniz matematikçileri basit bir veri girişi ile kolayca turkmath.org sitesinde ücretsiz duyurabilirsiniz. Sisteme giriş yapmak için gerekli bilgileri almak ya da görüş ve önerilerinizi bildirmek için iletişime geçmekten çekinmeyiniz. Katkı verenler listesi için tıklayınız.

Özkan Değer ozkandeger@gmail.com

DESTEK VERENLER

ja2019

31. Journees Arithmetiques Konferansı Organizasyon Komitesi

Web sitesinin masraflarının karşılanması ve hizmetine devam edebilmesi için siz de bağış yapmak, sponsor olmak veya reklam vermek için lütfen iletişime geçiniz.

ONLİNE ZİYARETÇİLER


©2013-2024 turkmath.org
Tüm hakları saklıdır